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Tipo : bachelorThesis
Título : Filogeografía de la “Ostra Nativa” (Striostrea prismatica. Gray, 1825) en las localidades de Ayangue y Salinas, Provincia de Santa Elena, Ecuador.
Autor : Cornejo Rodríguez, María Herminia, PhD.
Oñate Oquendo, David Fernando
Palabras clave : BIVALVOS;FILOGEOGRAFÍA
Fecha de publicación : sep-2018
Editorial : La Libertad: Universidad Estatal Península de Santa Elena, 2018.
Citación : Oñate Oquendo, David Fernando (2018). Filogeografía de la “Ostra Nativa” (Striostrea prismatica. Gray, 1825) en las localidades de Ayangue y Salinas, Provincia de Santa Elena, Ecuador. La Libertad. UPSE, Matriz. Facultad de Ciencias del Mar. 26p.
metadata.dc.description.sponsorship: UPSE
Resumen : La filogenia molecular es una herramienta que permite la diferenciación de especies a través de la comparación fragmentos o genomas completos de individuos y poblaciones, cuyas características morfológicas no permiten una clasificación taxonómica consistente basada únicamente en sus fenotipos. En el presente estudio se infiere las relaciones filogenéticas de dos poblaciones de la especie Striostrea prismatica en la provincia de Santa Elena (Ayangue y Salinas), Ecuador empleando aproximaciones de máxima probabilidad e inferencia bayesiana mediante la secuenciación de los genes mitocondriales citocromo oxidasa subunidad I (COX1) y 16S rRNA, con el fin de estimar su distribución y estado poblacional. Se obtuvieron 94 individuos de manera comercial (47 por localidad), los amplicones de COX1 (n=94) y 16S rRNA (n=11) fueron generados con cebadores específicos de la especie. Los modelos evolutivos fueron estimados con JmodelTest y los análisis filogenéticos se efectuaron en PAUP y MrBayes. La estructura poblacional fue evaluada con los paquetes ape y pegas (R) mediante un análisis de varianza molecular. Los resultados agruparon a los individuos en dos haplogrupos presentes en ambas poblaciones, sin una estructura poblacional definida (p<0.01). Los haplotipos son semejantes a aquellos descritos en la bibliografía, siendo el primero cercano a individuos estudiados en las costas de California y el segundo en Panamá. Finalmente, la topología de árboles consolida la ubicación de Striostrea prismatica como un grupo parafilético dentro de la familia Ostreidae, reforzando la creación de la subfamilia Striostreinae referida por primera vez en 1985 por Harry. Palabras clave: Bivalvos, Striostrea, Filogeografía, COX1, 16S rRNA, haplotipo
Descripción : Molecular phylogeny is a tool that allows the differentiation of species through the comparison of fragments or complete genomes of individuals and populations, whose morphological characteristics do not allow a consistent taxonomic classification based solely on their phenotypes. Phylogenetic relations were inferred in two populations of Striostrea prismatica species in the province of Santa Elena, Ecuador (Ayangue y Salinas), through maximum likelihood and bayesian approachs, by sequencing the mitochondrial genes Cytochrome Oxidase Subunit I (COX1) and 16S rRNA, in order to estimate its distribution and population status. We obtained 94 specimens by commercial means (47 per locality), the amplicons of COX1 (n=94) and 16S rRNA (n=11) were generated with specific primers developed for the species. Evolution models were estimated in JmodelTest and phylogenetics analyzes in PAUP and MrBayes, along with population statistics calculated using an Analysis of Molecular Variances in the ape and pegas packages (R). The results join the haplotypes in two major haplogroups present in both populations without a defined structure (p<0.01). This groups are similar to the ones described in previous bibliography, the first is close related to samples recollected in the Californian coast and the second to Panama. Finally, the topology of the trees consolidates the status of Striostrea prismatica as a paraphyletic group within Ostreidae family, asserting the creation of the Striostreinae subfamily referred for the first time by Harry in 1985. Keywords: Bivalve, Striostrea, phylogeography, COX1, 16S rRNA, haplotype
URI : http://repositorio.upse.edu.ec/handle/46000/4422
Aparece en las colecciones: Tesis de Biología Marina

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