Análisis comparativo de tres protocolos de extracción de ADN en cangrejo azul Cardisoma crassum, (Smith, 1870) del manglar del Cantón Eloy Alfaro, Esmeraldas-Ecuador, 2016.

Abstract

El cangrejo azul (Cardisoma crassum) es una especie representativa en la zona norte del manglar de Esmeraldas (Eloy Alfaro), esta especie tiene alto valor comercial, actualmente la especie se encuentra en un bajo nivel de población. sin embargo en cuanto a estudios en este crustáceo existen poca información, de esta manera se realizó este estudio en donde se permitió el uso de protocolos de extracción de ADN, con el fin de establecer la metodología óptima para obtener ADN de Cardisoma crassum, se evaluaron tres protocolos, Kit EZNA tissue DNA, Xiao o Fenol Cloroformo y Salino, en base a un análisis cualitativo comparativo de integridad de ADN a través de electroforesis en geles de agarosa y un análisis cuantitativo de concentración y pureza de los tres protocolos evaluados. Los resultados proporcionados por el Nanodrop 2000, en la obtención de concentración (ng/mg) y absorbancia (Abs260/Abs280nm), mostraron que el método salino posee un promedio de concentración de ADN de 193.38 ng/µl y una pureza de 1.978 (Abs260/Abs280). Los datos generados por los tres protocolos fueron sometidos a un análisis estadístico de ANOVA de un solo factor con un nivel de significancia α del 5% y comparación en Tukey con los tres protocolos, tanto en concentración y pureza, determinándose que si existe diferencia significativa (P=0.000<0.05) entre los tres protocolos; las comparaciones en Tukey de la concentración de ADN determina que el protocolo salino no muestra similitud con los métodos Kit y Fenol, y en la absorbancia de ADN el protocolo Kit EZNA muestra similitud en los resultados con el método Salino y no con Fenol.

Palabras claves: ADN mitocondrial, protocolos extracción, Kit, Salino, Cardisoma crassum.