Bioprospecting of bacteria present in sediments of a shrimp pond, Humedal La Segua
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Universidad Estatal Península de Santa Elena
Abstract
Description
Shrimp production generates sedimentable waste that contains organic matter (OM) and affects the crop due to the presence of pathogens. The objective of the study is to identify the diversity of bacteria in the sediment of a shrimp pond of the La Segua wetland, describing the shrimp production process, analysis of the physicochemical characteristics of the sediment taken at five points of the shrimp pond and the recognition of the bacterial microbiota through the analysis of the taxonomic profile of the 16S region by high-throughput sequencing. The results showed that shrimp production in the La Segua wetland does not have pertinent environmental management. The MO content is high (15-21%) according to the Mexican Official Standard NOM-021-RECNAT-2000, as well as organic carbon (3.2493%), phosphorus (3,400 mg/g) and total nitrogen (0.3688%). Thirteen groups of bacteria were recorded, highlighting the supergroup of uncultured bacteria (73.24%), Terrabacteria (7%) and Pseudomonadota (7%).
La producción del camarón genera residuos sedimentables que contiene materia orgánica (MO) y afecta al cultivo por la presencia de agentes patógenos. El objetivo del estudio fue identificar la diversidad de bacterias en el sedimento de una piscina camaronera del Humedal la Segua, cantón Chone-Manabí, describiendo el proceso productivo del camarón, análisis de las características fisicoquímicas del sedimento tomadas en cinco puntos de la piscina camaronera y el reconocimiento del microbiota bacteriano mediante el análisis del perfil taxonómico de la región 16S por secuenciación de alto rendimiento. Los resultados demostraron que la producción del camarón en el Humedal La Segua, no cuenta con gestión ambiental pertinente. El contenido de MO es alto (15-21%), así como el carbono orgánico (3,25%), fósforo (3,40 mg/g) y nitrógeno total (0,37%) en relación con los valores de criterios considerados. Se registraron 13 grupos de bacterias, destacando el supergrupo de bacterias no cultivadas (73,24%), Terrabacteria (7%) y Pseudomonadota (7%).
La producción del camarón genera residuos sedimentables que contiene materia orgánica (MO) y afecta al cultivo por la presencia de agentes patógenos. El objetivo del estudio fue identificar la diversidad de bacterias en el sedimento de una piscina camaronera del Humedal la Segua, cantón Chone-Manabí, describiendo el proceso productivo del camarón, análisis de las características fisicoquímicas del sedimento tomadas en cinco puntos de la piscina camaronera y el reconocimiento del microbiota bacteriano mediante el análisis del perfil taxonómico de la región 16S por secuenciación de alto rendimiento. Los resultados demostraron que la producción del camarón en el Humedal La Segua, no cuenta con gestión ambiental pertinente. El contenido de MO es alto (15-21%), así como el carbono orgánico (3,25%), fósforo (3,40 mg/g) y nitrógeno total (0,37%) en relación con los valores de criterios considerados. Se registraron 13 grupos de bacterias, destacando el supergrupo de bacterias no cultivadas (73,24%), Terrabacteria (7%) y Pseudomonadota (7%).