Estudio In silico de la proteína fotosintética PsbO en la babosa de mar Elysia sp. Risso, 1818.

Abstract

Los estudios in silico son importantes debido a su ayuda en el modelamiento de procesos biológicos e interacción de moléculas funcionales, convirtiéndose en una extensión de la experimentación in vitro e in vivo. Los estudios de procesos celulares in silico y modelamientos por homología de proteínas son escasos en el país, ocasionando déficit de conocimiento en la composición de los sistemas biológicos, riqueza de genes y proteínas presentes en especies con un bajo nivel de exhibición, como Elysia, los cuales obtienen genes que codifican proteínas fotosintéticas desde macroalgas, como PsbO. Para este estudio se obtuvo la secuencia de aminoácidos de PsbO en Elysia desde el GenBank, la similitud de la misma por medio de la herramienta BLAST. Se descargó la secuencia de PsbO en Elysia y se procedió al análisis de aminoácidos en BioEdit, en el servidor de Swiss-Model se consiguió el diseño 3D por medio del modelamiento por homología el cual indicó un índice QMEAN -2.31 y un índice global de modelamiento de 0.58. Por último, se realizó la cascada de señalización hipotética en la herramienta BioRender, indicándonos que la proteína se encuentra conservada en los organismos fotosintéticos y su activación es similar en estos.