Mapeo de restricción del gen 18S-ARNr: una alternativa rápida en la identificación molecular de Dunaliella sp

Abstract

En Ecuador los estudios de identificación de microalgas en su mayoría se basan principalmente en la taxonomía tradicional, utilizando claves y características morfológicas, que pueden conducir a sesgos debido a las variadas características celulares que generalmente presentan las especies. Lo que hace imprescindibles estudios moleculares aplicando métodos que aseguren su reconocimiento correcto. Por lo cual, este trabajo, se centró en identificar una cepa aislada en la Península de Santa Elena codificada como PM018 aplicando técnicas moleculares y utilizando el gen 18S-ARNr. Se llevó a cabo mediante la extracción, purificación y cuantificación del ADN extraído; amplificación por PCR del Gen 18S-ARNr utilizando los cebadores forward MA1, DSs y Ds0018F y reverse MA2, MA3 y Ds0018R, además de la elaboración de mapas de restricción in-silico y experimental. El ADN extraído tuvo una concentración máxima de 1930.2 ng/µL con 1.9 de relación de absorbancia A260/A280 nm. Se obtuvo un producto de 2173 pb con los cebadores MA1 y MA2, los cebadores DSs y MA3 no generaron productos amplificados; mientras que con Ds0018F y Ds0018R se obtuvo fragmentos de 660 pb aproximadamente. Este producto, fue sometido a digestión mediante endonucleasas de restricción obteniéndose mapas cercanamente símiles tanto in-silico como experimental. Los resultados obtenidos en este estudio comprueban que el mapeo del gen 18S-ARNr es una técnica fiable y asequible para la identificación de la microalga Dunaliella a nivel de género.