Análisis molecular in silico de la proteína Citocromo b en el género Mytilus

Abstract

Las proteínas tienen numerosas funciones dentro de los seres vivos, que ayudan a formar varias características estructurales, como el de la proteína del Cytb que forma parte de la cadena respiratoria en la mitocondria en todos los organismos eucariotas, así es el caso del género Mytilus. Las herramientas bioinformáticas como NCBI, Swiss-Model, BioEdit, ayudan a conocer las estructuras de organismos vivos mediante el análisis y procesamiento de datos, hoy en día existen proyectos denominados in silico cuya función es el modelado, simulación y visualización de una estructura. Para el estudio de la proteína del Cytb se la realizó mediante la obtención la secuencia de aminoácidos de la proteína en el NCBI además de alineaciones con otras secuencias de similitud realizadas en BioEdit, para la modelación proteica se utilizó el Swiss-Model. Por esta razón, esta investigación está dirigida al análisis de la acción de la proteína del Citocromo b en Mytilus y sus rutas metabólicas en la mitocondria a través de herramientas bioinformáticas. Citocromo b es una proteína secundaria, conformada de 435 aa, la comparación de las similitudes entre las secuencias mostró una conservación del 55,08% con la secuencia del PBD. La función principal es formar parte de la cadena trasportadora de electrones, fosforilación oxidativa, precisamente dentro del complejo lll junto con otros complejos, es decir, que las proteínas del Cytb tienen una función importante en el proceso de reparación celular y generación de energía, mientras que los programas bioinformáticos ayudan a la obtención de secuencias además de una modelación estructural, ya sea de nucleótidos, aminoácidos o proteínas.